生命与海洋科学学院王江新、赵丽青团队成功解析染色体水平的纤细裸藻基因组图谱
纤细裸藻（Euglena gracilis）是一种单细胞微生物，属于原生生物界裸藻门。作为间核生物的典型代表，纤细裸藻不仅在形态上兼具动植物细胞的特征，还能够通过光合作用自养或通过渗透营养异养。它独特的叶绿体结构为研究光合生物的内共生起源和叶绿体演化提供了宝贵的线索。
深圳大学生命与海洋科学学院王江新教授团队自2015年开始对裸藻基因组进行解析。经过近十年的努力，团队近日成功构建了纤细裸藻的染色体级别基因组图谱。相比2019年剑桥大学团队的研究结果，基因组组装连续性结果提高了1000倍。这使纤细裸藻成为裸藻纲中首个拥有染色体级别基因组的物种，对裸藻基因组学和合成生物学等相关领域的研究具有重大意义。
2024年7月16日，深圳大学生命与海洋科学学院王江新教授与化学与环境工程学院赵丽青教授团队在Nature出版集团旗下期刊ScientificData（五年平均影响因子：8.9）发表题为“A chromosome-level genome assembly for the paramylon-producing microalgaEuglena gracilis”的研究论文。研究团队利用二代Illumina、三代PacBio、Bionano以及Hi-C测序技术，组装得到高质量的染色体级基因组图谱。该基因组大小约2.37Gb，包含46条染色体，contigN50为619Kb，scaffoldN50为1.12Mb，并注释到了39362个蛋白编码基因。
纤细裸藻染色体级基因组图谱，展示了其多层次基因组特征：外圈数字代表46条染色体编号。图谱分为四层：基因密度（绿色）、转座子密度（蓝色）、串联重复序列密度（红色），反映各类元件在基因组中分布的整体情况；GC含量百分比（棕色），反映不同染色体区域碱基组成。中心为纤细裸藻的显微镜图像。
深圳大学生命与海洋科学学院教授王江新和化学与环境工程学院教授赵丽青为论文的共同通讯作者，深圳大学生命与海洋科学学院副研究员陈子熙、云南农业大学教授董扬与博士生段胜常为论文的共同第一作者，深圳大学生命与海洋科学学院为该论文的第一完成单位。深圳大学生命与海洋科学学院助理教授卞超、研究员王筠、教授黎双飞、副教授谢宁、教授徐颖、教授石琼、教授胡章立、教授雷安平等参与了本项目研究工作。
该研究得到了国家重点研发计划项目（2021YFA0910800，2018YFA0902500，2020YFA0908703）、国家自然科学基金项目（41876188）、雪园足球比分直播科创委（KCXFZ202002011006448）、雪园足球比分直播科技计划（KCXST20221021111206015，KCXFZ20201221173404012）和广东省自然科学基金（2024B1515020034）等项目资助。
